Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc5P27641 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms