Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfb2P27090 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgfb2P27090 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb2P27090 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms