Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NdnP25233 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NdnP25233 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NdnP25233 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NdnP25233 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NdnP25233 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms