Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkchP23298 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkchP23298 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms