Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PparaP23204 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PparaP23204 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PparaP23204 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PparaP23204 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PparaP23204 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PparaP23204 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms