Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klra1P20937 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klra1P20937 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms