Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc2P20801 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms