Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb9P20615 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms