Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18529 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18529 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18529 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18529 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18529 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18529 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18529 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18529 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18529 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms