Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb1P17919 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160 ms