Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkceP16054 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkceP16054 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkceP16054 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkceP16054 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms