Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd4P10628 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms