Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm3P0DP28 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calm3P0DP28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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