Protein–RNA interactions for Protein: P0DP26

Calm1, Calmodulin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm1P0DP26 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calm1P0DP26 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm1P0DP26 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calm1P0DP26 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms