Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P0C1Z5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
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