Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa9P09631 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa9P09631 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms