Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms