Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtaP09225 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtaP09225 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtaP09225 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtaP09225 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LtaP09225 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtaP09225 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms