Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeflP08551 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeflP08551 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeflP08551 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeflP08551 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeflP08551 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NeflP08551 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NeflP08551 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NeflP08551 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NeflP08551 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeflP08551 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeflP08551 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms