Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna7P06799 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna7P06799 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms