Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcrg-V1P06325 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcrg-V1P06325 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms