Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06321 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06321 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06321 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06321 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
P06321 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06321 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06321 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06321 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06321 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06321 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06321 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06321 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06321 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms