Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B2mP01887 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B2mP01887 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B2mP01887 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B2mP01887 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms