Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01820 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01820 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01820 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01820 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01820 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01820 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01820 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01820 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01820 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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