Protein–RNA interactions for Protein: P01677

Ig kappa chain V-VI region TEPC 601/TEPC 191, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01677 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01677 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01677 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01677 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01677 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01677 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01677 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01677 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms