Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01655 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01655 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01655 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01655 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01655 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01655 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01655 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01655 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01655 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01655 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01655 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01655 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01655 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01655 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01655 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01655 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms