Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01649 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01649 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01649 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01649 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01649 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01649 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01649 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01649 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01649 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms