Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lancl1O89112 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lancl1O89112 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms