Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sypl2O89104 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sypl2O89104 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms