Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp9O88851 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms