Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AurkcO88445 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkcO88445 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms