Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnal1O88327 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms