Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clec11aO88200 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms