Protein–RNA interactions for Protein: O55087

Mef2b, Myocyte-specific enhancer factor 2B, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mef2bO55087 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mef2bO55087 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mef2bO55087 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms