Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Bnip3O55003 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms