Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole2O54956 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole2O54956 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms