Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brs3O54798 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brs3O54798 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brs3O54798 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms