Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin1O54724 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin1O54724 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin1O54724 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin1O54724 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin1O54724 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin1O54724 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin1O54724 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin1O54724 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin1O54724 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cavin1O54724 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin1O54724 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cavin1O54724 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin1O54724 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cavin1O54724 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms