Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfibp2O35711 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp2O35711 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms