Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-ObO35424 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms