Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn4O35054 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms