Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp12O08736 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms