Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sema3aO08665 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema3aO08665 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms