Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4340L7N2C4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4340L7N2C4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms