Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U0

Vmn1r142, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r142K7N6U0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r142K7N6U0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r142K7N6U0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms