Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms