Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10428J3QNV7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms