Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3336J3QMQ6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3336J3QMQ6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms