Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm21818J3KMS6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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