Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AK157302I3ITR1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms